נולד באבן שמואל, שם שהו הוריו בשליחות חינוכית. בגיל ארבע עברה משפחתו לשכונת זיכרון מאיר בבני ברק. אביו אהרון, למד בישיבת מרכז הרב, והתקרב יותר לדת כשלמד בישיבת עזתה. בהמשך היה לרב צבאי ושירת במשך כ-30 שנה בתפקיד רב חיל המודיעין. אמו מרים היא בתו של משה עירוני, בן עירו של החזון איש, קוסובה, שעלה עמו לארץ ישראל. למד בישיבת אור ישראל לצעירים ולאחר מכן בישיבת קול יעקב, ישיבת ירוחם (בראשות הרב רפאל יונה טיקוצ'ינסקי) וישיבת מיר. בגיל 22 התגייס לצה"ל ושירת כמורה חייל. בשנות השמונים עסק בהלחנה ובניצוח על מקהלות בתי ספר. בתחילת שנות התשעים יצאה לאור סדרת התקליטים "חסידיש" של האחים ברונר שרוב לחניו הם של לפידות, ובהם הלהיטים "הוא יגאל אותנו", "ואתה קדוש", "ה' מה רבו צרי". בשנת 1996 הקים את להקת הדאנס החסידית אוף שימחעס. בשנת 2005 הקים יחד עם המפיק דוד פדידה את להקת הילדים "קינדרלעך" ושימש כמנהלה האמנותי. בשנת 2011 הקים עם עמירן דביר את להקת הרוק הדתית "יא בה ye", לאחר תקופה עזב את קינדערלך. הלחין שירים חסידיים רבים שמילותיהם מהמקורות אך רבים מלחניו הם למילים מקוריות שלו כמו הלהיט "עלה קטן שלי" שכתב והלחין בעבור אברהם פריד וזכה לגרסאות כיסוי של דודו אהרון עופר לוי ואחרים. בשנת 2008 הוציא אלבום סולו ראשון בשם "ואני המנגינה שלכם". בשנת 2000 התחיל להגיש לתוכנית ברדיו קול חי בימי שלישי, לאחר כמה חודשים זה עבר ליום שישי בשם "אישי בשישי" בימי שישי ברדיו קול חי, ב-26 במאי 2020 הגיש את תוכנית האחרונה שלו ברדיו קול חי. הגיש בין השנים 2007–2010 תוכנית לילדים ביום שישי בערוץ 10 בשם "חמישה בעקבות הפרשה" העוסקת בפרשת השבוע. בין השנים 2011–2015 היה חבר ה"וועדה המקצועית" בתוכנית המציאות בית ספר למוזיקה בערוץ 2. זכה ב-2013 בפרס אקו"ם לזמר חסידי. בקיץ 2013 חבר למפיק יוחאי כפיר איתו הקים את הלייבל YOYO למוזיקה ותרבות יהודית שבין השאר מייצג את ההרכב המוזיקלי "מועצת השירה היהודית" המתרכז בשירה יהודית נוסטלגית. באותה שנה אף נעשה מנהל מוזיקלי בלהקת הילדים "צמד ילד" שאותה הקים יחד עם איש יחסי הציבור אריה הינץ. ב-2017 הקים את להקת הפופ היהודי "אוומן". באותה שנה הוציא גרסת כסוי לשיר "תעיתי כשה אובד" (בקש עבדך) של הראל טל. רבים מלחניו הפכו ללהיטים, ביניהם: "הוא יגאל אותנו" (בביצוע אריה ברונר) "מודה אני" ו"עלה קטן שלי" (בביצוע אברהם פריד) "עם ישראל לא מפחד" (בביצוע יעקב שוואקי), "אשת חיל" ו"אלע חסידים". ב-3 ביולי 2020 החל לשדר תוכנית בשם "אישי בשישי" בימי שישי בקול פליי', מאוגוסט 2020 הוא משדר שם תוכנית פותחים שבוע בכל במוצאי שבת ובמאי 2022 הפסיק לשדר את התכנית. באוגוסט 2020 הוציא ביחד עם שוקי סלומון את "שיר השמחה". הגיש תוכנית אקטואליה יומית, "שמונה אפס אפס", ברדיו "קול ברמה", לצד העיתונאי יקי אדמקר. החל משנת 2020 הנחה למשך ארבע עונות את תוכנית הנוער "כמו גדולים" בערוץ הידברות. באפריל 2021 לוהק לסרטם של בני פרדמן ושלום אייזנבך "בית", המועמד ל-9 פרסי אופיר לשנת 2023. בינואר 2022 לוהק לתפקיד משנה בסרטו של יהודה גרובייס "הסיפור שנשכח" שצולם בפולין, ובאפריל לוהק גם לסרט רשב"י של גרובייס. בבפרואר 2023 יצאה לאור סדרה חינוכית לילדים אותה הפיק בשם "החברים של ישי".

ב-1994 נישא לסלין עובדיה. הבמאית רחל רוזנברג ליוותה אותם בהכנות לקראת החתונה והלבטים הנלווים לה והוציאה סרט תיעודי מתקופה זאת בשם "מדרש חופה". בני הזוג הורים לשלושה ומתגוררים בנתניה.

ישי לפידות חבר במספר להקות בו זמנית והמנהל של רובן אוף שימחעס - בה חברים ישי לפידות (סולן), שמשון דלבקוביץ' (נפטר ב-2014), בני שוולב ויענקי אלפא. "יא בה ye" - בה חברים לפידות ועמירן דביר מועצת השירה היהודית - בה חברים לפידות ועוד שבעה: אייל טויטו, גיל ישראלוב, אלי כהן, נתי חדד, קובי ברומר, משה דן ונתנאל ישראל. אוומן - בה לפידות לא משתתף כסולן אלא רק מנהל ומפיק. חברי הלהקה הם: נתנאל ישראל איציק ברוך וקובי ברוך, ושרולי ברונכר.

טלוויזיה קולנוע